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https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/41308| ORCID: |  http://orcid.org/0009-0001-0669-7852 |
| Tipo do documento: | Trabalho de Conclusão de Curso |
| Tipo de acesso: | Acesso Aberto Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States |
| Título: | Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe |
| Título(s) alternativo(s): | REST API Development and Integration for Communication between the Pannotator and the Medpipe |
| Autor(es): | Gonçalves, Rafael Faria Macedo |
| Primeiro orientador: | Santos, Anderson Rodrigues dos |
| Primeiro membro da banca: | Soares, Alexsandro Santos |
| Segundo membro da banca: | Brito, Luiz Fernando Afra |
| Resumo: | O presente Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) representa um esforço para integrar duas ferramentas na área de bioinformática. A integração bem sucedida do sistema Medpipe ao Pannotator, viabilizada pelo microsserviço ms-medpipe, oferece uma abordagem para a análise genômica. O microsserviço ms-medpipe, desenvolvido em Kotlin com o framework Spring Boot, desempenha um papel central na automação do processamento Medpipe. A utilização de endpoints REST, como a execução do Medpipe de forma assíncrona, busca de status e das predições geradas, contribui para a modularidade e escalabilidade do sistema. A disponibilização da documentação dos endpoints, exemplos de solicitações e logs detalhados facilitam a compreensão e utilização do ms-medpipe. Os resultados obtidos destacam a importância das informações fornecidas pelo Medpipe, enriquecendo a anotação genômica com mais detalhes, como a densidade de epítopos maduros (MED) e a classificação de proteínas de acordo com suas localizações subcelulares. Com os resultados obtidos com a integração utilizando o ms-mdepipe o Pannotator ficou equivalente a programas que tentam prover mais do que apenas anotação de função acrescentando dados sobre anotação sobre potencial imunológico, estrutura e localização celular. |
| Palavras-chave: | Bioinformática Bioinformatics Microsserviços Microservices Pannotator Pannotator Medpipe Medpipe Genômica Genomics |
| Área(s) do CNPq: | CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO |
| Idioma: | por |
| País: | Brasil |
| Editora: | Universidade Federal de Uberlândia |
| Referência: | GONÇALVES, Rafael Faria Macedo. Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe. 2023. 41 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2023. |
| URI: | https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/41308 |
| Data de defesa: | 9-Dez-2023 |
| Aparece nas coleções: | TCC - Sistemas de Informação (Uberlândia) |
Arquivos associados a este item:
| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| IntegracaoMedpipePannotator.pdf | TCC | 984 kB | Adobe PDF |  Visualizar/Abrir |
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