Publicação: Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe
Carregando...
Tipo do documento
Data
Direito de acesso
Programa
Área do conhecimento
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Orientador
Coorientador
Resumo
O presente Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) representa um esforço para integrar duas ferramentas na área de bioinformática. A integração bem sucedida do sistema
Medpipe ao Pannotator, viabilizada pelo microsserviço ms-medpipe, oferece uma abordagem para a análise genômica. O microsserviço ms-medpipe, desenvolvido em Kotlin
com o framework Spring Boot, desempenha um papel central na automação do processamento Medpipe. A utilização de endpoints REST, como a execução do Medpipe de
forma assíncrona, busca de status e das predições geradas, contribui para a modularidade
e escalabilidade do sistema. A disponibilização da documentação dos endpoints, exemplos
de solicitações e logs detalhados facilitam a compreensão e utilização do ms-medpipe.
Os resultados obtidos destacam a importância das informações fornecidas pelo Medpipe,
enriquecendo a anotação genômica com mais detalhes, como a densidade de epítopos maduros (MED) e a classificação de proteínas de acordo com suas localizações subcelulares.
Com os resultados obtidos com a integração utilizando o ms-mdepipe o Pannotator ficou equivalente a programas que tentam prover mais do que apenas anotação de função
acrescentando dados sobre anotação sobre potencial imunológico, estrutura e localização
celular.
Abstract
Palavras-chave
Bioinformática, Bioinformatics, Microsserviços, Microservices, Pannotator, Pannotator, Medpipe, Medpipe, Genômica, Genomics
Citação
GONÇALVES, Rafael Faria Macedo. Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe. 2023. 41 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2023.
DOI
Avaliação
Revisão
Suplementado Por
Referenciado Por
Licença Creative Commons
Exceto quando indicado de outra forma, a licença deste item é descrita como Acesso Aberto