1. Repositório Institucional - Universidade Federal de Uberlândia
2. Faculdade de Computação (FACOM)
3. TCC - Sistemas de Informação (Uberlândia)

ORCID:	http://orcid.org/0009-0001-0669-7852
Document type:	Trabalho de Conclusão de Curso
Access type:	Acesso Aberto Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United States
Title:	Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe
Alternate title (s):	REST API Development and Integration for Communication between the Pannotator and the Medpipe
Author:	Gonçalves, Rafael Faria Macedo
First Advisor:	Santos, Anderson Rodrigues dos
First member of the Committee:	Soares, Alexsandro Santos
Second member of the Committee:	Brito, Luiz Fernando Afra
Summary:	O presente Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) representa um esforço para integrar duas ferramentas na área de bioinformática. A integração bem sucedida do sistema Medpipe ao Pannotator, viabilizada pelo microsserviço ms-medpipe, oferece uma abordagem para a análise genômica. O microsserviço ms-medpipe, desenvolvido em Kotlin com o framework Spring Boot, desempenha um papel central na automação do processamento Medpipe. A utilização de endpoints REST, como a execução do Medpipe de forma assíncrona, busca de status e das predições geradas, contribui para a modularidade e escalabilidade do sistema. A disponibilização da documentação dos endpoints, exemplos de solicitações e logs detalhados facilitam a compreensão e utilização do ms-medpipe. Os resultados obtidos destacam a importância das informações fornecidas pelo Medpipe, enriquecendo a anotação genômica com mais detalhes, como a densidade de epítopos maduros (MED) e a classificação de proteínas de acordo com suas localizações subcelulares. Com os resultados obtidos com a integração utilizando o ms-mdepipe o Pannotator ficou equivalente a programas que tentam prover mais do que apenas anotação de função acrescentando dados sobre anotação sobre potencial imunológico, estrutura e localização celular.
Keywords:	Bioinformática Bioinformatics Microsserviços Microservices Pannotator Pannotator Medpipe Medpipe Genômica Genomics
Area (s) of CNPq:	CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Language:	por
Country:	Brasil
Publisher:	Universidade Federal de Uberlândia
Quote:	GONÇALVES, Rafael Faria Macedo. Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe. 2023. 41 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2023.
URI:	https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/41308
Date of defense:	9-Dec-2023
Appears in Collections:	TCC - Sistemas de Informação (Uberlândia)

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