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Document type: Trabalho de Conclusão de Curso
Access type: Acesso Aberto
Title: Construção de modelo e triagem virtual baseada em forma de potenciais inibidores da protease NS2B-NS3 do vírus da dengue
Alternate title (s): Model building and shape-based virtual screening of potential dengue virus NS2B-NS3 protease inhibitors
Author: Moura, Vinícius Magalhães de
First Advisor: Nicolau Junior, Nilson
First member of the Committee: José, Diego Pandeló
Second member of the Committee: Cunha Júnior, Jair Pereira da
Summary: O vírus da dengue é um membro do gênero Flavivirus da família Flaviviridae e inclui quatro sorotipos diferentes (DENV 1 A 4). Estimativas sugerem que metade da população vive em áreas de risco de infecção. Portanto, há uma necessidade urgente de identificar e desenvolver fármacos antivirais eficazes para esse vírus. Uma abordagem muito utilizada é a procura por compostos capazes de inibir a replicação viral. A proteína NS2B-NS3 tem papel importante na replicação do vírus sendo responsável pela clivagem de poliproteínas virais e consequente maturação da partícula viral, sendo um alvo interessante para desenvolvimento de drogas. Assim este trabalho propõe a construção de um modelo para triagem virtual de potenciais inibidores da protease NS2B-NS3 do vírus da dengue a partir dos bancos de dados Nubbe (produtos naturais) e ZINC (FDA - fármacos liberados pelo Food and Drug Administration dos EUA), análises de ancoragem molecular e estudo farmacocinético de toxicidade das melhores moléculas encontradas. Na triagem o programa VROCS gerou um ranking com os 500 melhores compostos que foram submetidos a ancoragem molecular pelo GOLD. A partir da ancoragem foi possível selecionar duas moléculas de cada banco com melhor score de ancoragem e estas submetidas a análise farmacocinética de toxicidade. Por fim, foi possível concluir que os compostos Candesartana e Derifenacina, apresentam potencial de inibição da replicação do vírus da dengue e os compostos do 2166 e 680, apesar de apresentarem bons resultados na ancoragem necessitam de maiores estudos em relação a sua atividade biológica.
Abstract: Dengue virus is a member of the Flavivirus genus of the Flaviviridae family and includes four different serotypes (DENV 1 to 4). Estimates suggest that half of the population lives in areas at risk of infection. Therefore, there is an urgent need to identify and develop effective antiviral drugs for this virus. A widely used approach is the search for compounds capable of inhibiting viral replication. The NS2B-NS3 protein plays an important role in virus replication, being responsible for the cleavage of viral polyproteins and consequent maturation of the viral particle, being an interesting target for drug development. Thus, this work proposes the construction of a model for virtual screening of potential inhibitors of the NS2B-NS3 protease of the dengue virus, in addition to using the Nubbe (natural products) and ZINC (FDA - drugs approved by the US Food and Drug Administration) databases, molecular anchoring analysis and pharmacokinetic toxicity study of the best molecules found. In the screening, the VROCS program generated a ranking with the 500 best compounds that were submitted to molecular anchorage by GOLD. From the anchoring, it was possible to select two molecules from each bank with the best anchoring score and these were subjected to pharmacokinetic toxicity analysis. and the compounds of 2166 and 680, despite presenting good results in anchoring, need further studies in relation to their biological activity.
Keywords: vírus da dengue
Dengue virus
NS2B-NS3
NS2B-NS3
Triagem virtual
Virtual screening
Ancoragem
Docking
Area (s) of CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
Language: por
Country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Uberlândia
Quote: MOURA, Vinícius Magalhães de. Construção de modelo e triagem virtual baseada em forma de potenciais inibidores da protease NS2B-NS3 do vírus da dengue. 2023. 30 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2023.
URI: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/38363
Date of defense: 26-Jan-2023
Appears in Collections:TCC - Biotecnologia (Uberlândia)

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