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https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/36230
Tipo de documento: | Dissertação |
Tipo de acceso: | Acesso Aberto |
Título: | Análise comparativa in sílico de novos peptídeos derivados de proteínas imunodominantes de Toxoplasma gondii, com potencial para serem aplicados como ferramentas para o diagnóstico da toxoplasmose humana |
Título (s) alternativo (s): | In silico comparative analysis of novel peptides derived from Toxoplasma gondii immunodominant proteins as potential tools for the diagnosis of human toxoplasmosis |
Autor: | Betancourt, Angelis Del Valle Benitez |
Primer orientador: | Mineo, José Roberto |
Primer miembro de la banca: | Santana, Silas Silva |
Segundo miembro de la banca: | Nicolau Junior, Nilson |
Resumen: | Os testes sorológicos para o diagnóstico da infecção por Toxoplasma gondii têm limitações para diferenciar a infecção aguda da infecção crônica, o que é importante para determinar o manejo clínico e o tratamento de mulheres grávidas e indivíduos imunocomprometidos com toxoplasmose. No presente estudo, foram realizadas análises in sílico para caracterizar epítopos imunogênicos das proteínas SAG1, SAG2A, GRA1, GRA2, GRA3, GRA5, GRA6, GRA7, MAG1, BSR4 e CCp5A, as quais podem emergir como novas alternativas para melhorar o diagnóstico da toxoplasmose. Uma vez que as sequências proteicas foram recuperadas do banco de dados Toxodb, diferentes parâmetros foram calculados, incluindo características físico-químicas, valores de acessibilidade e antigenicidade. Alinhamento de sequências múltiplas, modelagem de estrutura 3D, refinamento e validação também foram realizados entre todos os 11 peptídeos. Considerando os resultados obtidos da combinação de todos os parâmetros analisados, pode-se concluir que os peptídeos das proteínas SAG1, GRA3 e BSR4 foram considerados os mais promissores, por serem estáveis, hidrofílicos, com valores significativos de antigenicidade e acessibilidade na superfície da proteína. Portanto, a aplicação destes peptídeos pode ser caracterizada como boas alternativas para a padronização de novos ensaios de imunodiagnóstico para toxoplasmose. |
Abstract: | Serological tests for the diagnosis of Toxoplasma gondii infection have limitations in differentiating acute from chronic infection, which is important in determining the clinical management and treatment of pregnant women and immunocompromised individuals with toxoplasmosis. Here, an in silico analysis was performed to characterize immunogenic epitopes of SAG1, SAG2A, GRA1, GRA2, GRA3, GRA5, GRA6, GRA7, MAG1, BSR4, and CCp5A proteins that may emerge as alternatives to improve the diagnosis of toxoplasmosis. Once the protein sequences were retrieved from the Toxodb database, different parameters were calculated including physicochemical characteristics, accessibility values, and antigenicity. Multiple sequence alignment, 3D structure modeling, refinement, and validation were also performed among all 11 peptides. Considering the results from the combination of all parameters analyzed, it can be concluded that the peptides of SAG1, GRA3, and BSR4 proteins were found to be stable, hydrophilic, with significant antigenicity values, and accessibility on the protein surface. Thus, the use of these peptides may suggest alternative measures for the design and standardization of new immunodiagnostic assays for toxoplasmosis. |
Palabras clave: | Toxoplasma gondii toxoplasmose analise in silico peptídeos epítopos imunodominantes imunodiagnóstico toxoplasmosis immunodiagnosis in silico peptide predictions immunodominant epitopes Imunologia |
Área (s) del CNPq: | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::PARASITOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA::IMUNOLOGIA APLICADA |
Tema: | Imunologia Toxoplasma gondii Toxoplasmose Peptídeos Sorodiagnóstico |
Idioma: | por |
País: | Brasil |
Editora: | Universidade Federal de Uberlândia |
Programa: | Programa de Pós-graduação em Imunologia e Parasitologia Aplicadas |
Cita: | BETANCOURT, Angelis Del Valle Benitez. Análise comparativa in sílico de novos peptídeos derivados de proteínas imunodominantes de Toxoplasma gondii, com potencial para serem aplicados como ferramentas para o diagnóstico da toxoplasmose humana. 2022. 65 f. Dissertação (Mestrado em Imunologia e Parasitologia Aplicadas) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2022. DOI: http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.406 |
Identificador del documento: | http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.406 |
URI: | https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/36230 |
Fecha de defensa: | 27-may-2022 |
Aparece en las colecciones: | DISSERTAÇÃO - Imunologia e Parasitologia Aplicadas |
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