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ORCID:  http://orcid.org/0000-0001-6835-441X
Document type: Trabalho de Conclusão de Curso
Access type: Acesso Aberto
Title: Algoritmos de otimização de inteligência de enxame aplicados ao problema de predição de proteína
Alternate title (s): Swarm optimization algorithms applied to protein structure prediction problem
Author: Cavalcanti, Douglas Monteiro
First Advisor: Brasil, Christiane Regina Soares
First member of the Committee: Lima, Maria Adriana Vidigal de
Second member of the Committee: Furtado, Daniel Antônio
Summary: O problema de predição de estrutura de proteínas é um dos mais desafiadores da área da bioinformática. Muitos dos fatores envolvidos no processo de dobramento ainda não são conhecidos, motivo pelo qual o problema é usualmente tratado a partir de modelos simplificados que consideram apenas algumas poucas características das proteínas, como o modelo Hidrofóbico-Polar 2D. Entretanto, mesmo a partir de modelos simplificados, predizer a estrutura de uma proteína é um problema da classe NP-completo, e por isso, abordagens não determinísticas têm sido largamente aplicadas ao problema. Neste trabalho, dois métodos não determinísticos baseados em Inteligência de Enxame, Otimização por Colônia de Formiga e Otimização por Enxame de Partícula, foram aplicados ao Problema de Estrutura de Proteínas no modelo Hidrofóbico-Polar 2D com inserção do método de busca por \textit{pull move}. Para cada algoritmo três diferentes abordagens foram usadas, cada uma implementando um procedimento diferente de construção de conformações de proteínas. O objetivo do trabalho foi definir qual o melhor método para tratamento do problema, a partir da comparação entre os métodos e suas diferentes abordagens.
Keywords: Otimização por Enxame de Partícula
Otimização por Colônia de Formiga
Predição de Estrutura de Proteínas
Inteligência de Enxame
Modelo 2D HP
Area (s) of CNPq: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO::MATEMATICA DA COMPUTACAO::MODELOS ANALITICOS E DE SIMULACAO
Language: por
Country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Uberlândia
Quote: CAVALCANTI, Douglas Monteiro. Algoritmos de Otimização de Inteligência de Enxame Aplicados ao Problema de Predição de Proteína. 2018. 43 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciência da Computação) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2018.
URI: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/24120
Date of defense: 18-Dec-2018
Appears in Collections:TCC - Ciência da Computação

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