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Document type: Tese
Access type: Acesso Aberto
Title: Aspectos evolutivos das proteínas MyD88 e Tollip da via NF-KB
Author: Luiz, Denis Prudencio
First Advisor: Brandeburgo, Malcon Antonio Manfredi
Summary: O sistema imune inato atua como a primeira linha de defesa de todos os animais. Ele possui células e moléculas que atuam no combate de diversos tipos de patógenos. As células de defesas possuem receptores de reconhecimento, as quais, desencadeiam reações para a produção de moléculas que irão combater os patógenos. A via NF-κB é uma via conservada nos animais, ela faz parte deste sistema e possui duas moléculas importantes para seu funcionamento, MyD88 e Tollip. O papel da proteína MyD88 é de acoplamento juntamente com outras proteínas, transmitindo o sinal na parte interna das células, enquanto Tollip funciona como um regulador negativo no final da mesma via. Essas duas proteínas tiveram suas sequências analisadas em diferentes espécies de animais, seus aspectos evolucionários foram estudados, dentre os domínios da proteína MyD88, e entre as sequências completa e as partes conservadas da Tollip. Utilizando ferramentas da bioinformática podemos ver que Tollip possui sucessivas modificações para otimizar sua estabilização acumulando resíduos alifáticos. Foram encontradas diferenças na estabilidade desta proteína entre primatas e artrópodes. Além de Tollip apresentar a necessidade de íon Ca2+ para manutenção de sua cavidade, foi possível identificar um ligando 768 provavelmente relacionado à inibição de Tollip. Na proteína MyD88 identificamos uma maior identidade nas sequências de primatas em relação às outras espécies analisadas, e foi reforçado a alta similaridade de alguns aminoácidos da interface com a funcionalidade da proteína. O domínio TIR demonstrou possuir maior identidade entre os domínios da proteína MydD88 e uma maior ancestralidade da sua sequência em relação à região DM, podendo sugerir uma relação com o maior número de parceiros de interação.
Abstract: The innate immune system plays as the first line of defense of all animals. It possesses cells and molecules that act in fighting many types of pathogens. The defense cells carry recognition receptors, which, trigger reactions for the production of molecules that will combat the pathogens. The NF-kB pathway is a pathway conserved in animals, it is part of this system and possesses two important molecules for its operation, MyD88 and Tollip. The role of MyD88 protein is coupling together with other proteins and transmit the signal inside the cell, while Tollip functions as a negative regulator at the end of the same pathway. These two protein sequences were analyzed in different animal species, their evolutionary aspects were studied among the domains of the MyD88 protein, and between the complete sequences and conserved parts of the Tollip. Using bioinformatics tools, we can see that Tollip has successive modifications to optimize its stabilization accumulating aliphatic residues. Differences were found between the stability of primates and arthropods proteins. In addition to the Tollip showing the need for ion Ca2 + for the maintenance of the cavity, it was possible to identify a ligand 768 probably related to inhibition of Tollip. In MyD88 protein we identified a greater identity in sequences of primates in relation to other species analyzed, also it was enhanced the high similarity of some amino acids interface with the functionality of the protein. The TIR domain has demonstrated greater identity between the fields of protein and a greater MydD88 ancestry of its sequence regarding the MD region, which may suggest a relationship with the largest number of interaction partners.
Keywords: Imune
MyD88
Tollip
Bioinformática
Domínios
Immune
Bioinformatics
Domains
Sistema imune
Area (s) of CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
Language: por
Country: BR
Publisher: Universidade Federal de Uberlândia
Institution Acronym: UFU
Department: Ciências Biológicas
Program: Programa de Pós-graduação em Genética e Bioquímica
Quote: LUIZ, Denis Prudencio. Aspectos evolutivos das proteínas MyD88 e Tollip da via NF-KB. 2015. 87 f. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015.
URI: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/15768
Date of defense: 10-Dec-2015
Appears in Collections:TESE - Genética e Bioquímica

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