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Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acceso: Acesso Aberto
Título: Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade
Autor: Paiva, Humberto Alencar de
Primer orientador: Takahashi, Eduardo Kojy
Primer miembro de la banca: Barbosa Neto, Newton Martins
Segundo miembro de la banca: Santos, Helio Ferreira dos
Resumen: Estudo do sistema DNA-cisplatina usando a teoria do funcional da densidade (DFT) compara a eficiência dos funcionais de correlação e troca LDA e GGA(PBE) na simulação das bases nitrogenadas como também os conjuntos de base DZP e DZ. Fazendo as opções DZP e LDA e com a utilização de pseudopotenciais Ceperley-Alder de norma conservada executa cálculos de simulação da cisplatina, bases isoladas, pares de bases, fragmento de DNA com dois pares de bases GG e do sistema DNA-ciplatina ligada em conjunto de bases GG e AG. Apresenta roteiro de execução para a gradual aproximação da estrutura de fato do DNA. Reedita para essas estruturas resultados estabelecidos na literatura científica, como apresenta novos resultados para a distribuição eletrônica do DNA. Apresenta argumenta ção, baseada na interação de dipolos entre cisplatina e DNA para a existência de uma barreira de potencial que restringe a possibilidade da ligação para o caso da ligação na sequencia guanina-adenina do DNA.
Abstract: Study of the DNA-cisplatin system using the Density Functional Theory(DFT), compares the eficiency of the correlation and exchange functionals LDA and GGA (PBE) in the simulation of the nitrogen bases as well as the basis sets DZP and DZ. Taking DZP and LDA options and with the use of the norm-conserved pseudopotentials Ceperley-Alder, simulate the sistems; cisplatina, isolated DNA bases, pairs of bases, DNA fragment with two pairs of bases GG and on the DNA-ciplatin system attached in GG and GA bases. It presents script of execution for the gradual approach of the real structure of the DNA. Reedits for these structures facts established in scientific literature, as it presents new facts for the electronic distribution of the DNA. Argues based in the interaction of dipoles between cisplatin and DNA, the existence of a potential barrier that restricts the possibility of the bond for the case of the linking in sequence GA of the DNA.
Palabras clave: Teoria do funcional da densidade
Aproximação de densidade local
Aproximação de gradiente generalizado
DNA
Cisplatina
Density functional theory
Local density approximation
Generalized gradient approximation
Cisplatin
Área (s) del CNPq: CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICA
Idioma: por
País: BR
Editora: Universidade Federal de Uberlândia
Sigla de la institución: UFU
Departamento: Ciências Exatas e da Terra
Programa: Programa de Pós-graduação em Física
Cita: PAIVA, Humberto Alencar de. Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade. 2007. 99 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2007.
URI: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/15679
Fecha de defensa: 12-jun-2007
Aparece en las colecciones:DISSERTAÇÃO - Física

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