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ORCID:  http://orcid.org/0000-0003-2471-0114
Document type: Dissertação
Access type: Acesso Aberto
Title: Prospecção, análises e design in silico de potenciais inibidores da proteína NS3 do vírus zika
Alternate title (s): Prospection, analysis and in silico design of potential inhibitors of zika virus' NS3 protein
Author: Resende, Millena Almeira
First Advisor: Gomes, Matheus de Souza
First coorientator: Nicolau Junior, Nilson
First member of the Committee: Morandi Filho, Romualdo
Second member of the Committee: Naveca, Felipe Gomes
Summary: O vírus Zika pertence ao gênero Flavivirus e é transmitido, principalmente, pela fêmea do mosquito Aēdēs ægypti. Indivíduos infectados apresentam sintomas variáveis e podem ter complicações neurológicas, sendo algumas irreversíveis, como a microcefalia, em casos de infecção intrauterina. Além disso, ainda não existem medicamentos eficazes para o tratamento desta virose. Por isso, este trabalho teve como objetivo, identificar potenciais compostos com ação antiviral utilizando como alvo terapêutico a protease NS3 do vírus Zika. Para tanto, foram empregados métodos computacionais como a construção de modelo baseado em forma, triagem virtual, docking molecular covalente e não covalente, modificação molecular e predição de características farmacológicas. A obtenção da proteína e dos compostos testados se deu através de banco de dados virtuais de compostos, tais como: compostos naturais, leadlike, druglike e compostos aprovados (Ex: fármacos aprovados pelo FDA). Por meio da triagem virtual e docking molecular foi possível selecionar os compostos de cada grupo com maior afinidade à protease NS3: 8D, 1L, 6F e 1N. O composto identificado como 6F refere-se ao fármaco Betrixaban indicando um potencial reposicionamento deste para o uso contra o vírus Zika. O composto 1N refere-se à Criptomoscatona D1, presente nas plantas Lauraceae Cryptocarya moschata e Lauraceae Cryptocarya mandioccana. Os compostos 8D e 1N obtiveram os melhores resultados de docking e farmacocinética e seriam os mais indicados para análises in vitro.
Abstract: Zika virus belongs to the Flavivirus genus and is transmitted, mainly, by the Aēdēs ægypti female mosquito. Infected individuals have variable symptoms and may have neurological complications, some of which are irreversible, such as microcephaly, in cases of intrauterine infection. In addition, there are still no effective drugs for the treatment of this viral disease. However, there are still no effective drugs to treat this disease. That’s why, this work aimed to identify potential compounds with antiviral action using as a therapeutic target the Zika virus NS3 protease. Therefore, computational methods such as the construction of a shape-based model, virtual screening, covalent and non-covalent molecular docking, molecular modification and prediction of pharmacological characteristics were used. The protein and compounds tested were obtained through a virtual database of compounds, such as: natural compounds, leadlike, druglike and approved compounds (eg, drugs approved by the FDA). Through virtual screening and molecular docking, it was possible to select the compounds from each group with greater affinity to the NS3 protease: 8D, 1L, 6F and 1N. The compound identified as 6F refers to the drug Betrixaban indicating a potential repositioning of it for use against Zika virus. Compound 1N refers to Cryptomoscatone D1, present in Lauraceae Cryptocarya moschata and Lauraceae Cryptocarya mandioccana. The 8D and 1N compounds obtained the best docking and pharmacokinetic results and would be the most suitable for in vitro analysis.
Keywords: docking molecular
antiviral
descobrimento de fármacos
molecular docking
antiviral
drug discovery
Area (s) of CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIA::FARMACOLOGIA BIOQUIMICA E MOLECULAR
Subject: Bioquímica
Vírus da Zika
Proteínas - Síntese
Agentes antivirais
Language: por
Country: Brasil
Publisher: Universidade Federal de Uberlândia
Program: Programa de Pós-graduação em Genética e Bioquímica
Quote: RESENDE, Millena almeida. Prospecção, análises e design in silico de potenciais inibidores da proteína NS3 do vírus Zika. 2022. 94 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Bioquímica) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2022. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.5020
Document identifier: http://doi.org/10.14393/ufu.di.2022.5020
URI: https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/34628
Date of defense: 31-Jan-2022
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