Publicação: Detecção de genes diferencialmente expressos na formiga urbana Camponotus vittatus (Hymenoptera, Formicinae)
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CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA
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Resumo
Insetos sociais despertam grande curiosidade, interesse e uma vontade de
se compreender as bases moleculares da vida social. A identificação de genes
diferencialmente expressos tem sido usada para o entendimento não só da
função gênica, mas também dos mecanismos moleculares de diferentes
processos biológicos. Nesse estudo, foram testados dois protocolos para extração
de RNA total de Camponotus vittatus e a técnica de Differential Display Reverse
Transcriptase Polymerase Chain Reaction (DDRT-PCR) foi utilizada para a
identificação de genes diferencialmente expressos em casta, sexo e nos estágios
de desenvolvimento dessa formiga. O método de extração de RNA baseado em
Chomczynski e Sacchi (1987) demonstrou ser o mais eficaz. A técnica DDRTPCR
foi eficiente para a detecção de genes diferencialmente expressos de C.
vittatus. Três expressed sequence tags (ESTs) foram seqüenciadas e análises por
bioinformática não detectaram similaridade com seqüências depositadas em
banco de dados, podendo ser novas e, talvez, específicas de C. vittatus. Essas
seqüências foram depositadas no banco de dados dbEST. Um fragmento
diferencialmente expresso em operária foi obtido com a combinação dos primers:
HT11G e AP03. Os resultados do seqüenciamento e das análises por
bioinformática revelaram que tal EST foi isolada da bactéria endossimbionte de C.
vittatus, pois foi detectada a presença de um domínio grol e alta similaridade com
diversas proteínas da família das chaperoninas, proteínas presentes nas bactérias
endossimbiontes do gênero.
Abstract
Social insects inspire great curiosity, interest and a wish to know the social
life molecular basis. Differentially expressed genes identification has been used
with the objective to understand either the gene function and the molecular
mechanisms of different biological processes. In this study, two protocols for the
total RNA extraction from Camponotus vittatus were tested and the Differential
Display Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction (DDRT-PCR)
technique was used with the aim to identify differentially expressed genes in caste,
sex and development stages of this ant. The RNA extraction method, based in
Chomczynski e Sacchi (1987), was the most efficacious. The DDRT-PCR
technique was efficient for the detection of differentially expressed genes from C.
vittatus. Three expressed sequence tags (ESTs) were sequenced and the analysis
with bioinformatics tools failed in detect similarity with those sequences from data
banks. These sequences may be new and, perhaps, specific of C. vittatus. They
were deposited in dbEST database. A differentially expressed fragment, specific of
works, was obtained with the primers HT11G and AP03. The results of its
sequence and the analysis by bioinformatics revealed that this EST was, in fact,
been isolated from the endosymbiotic bacteria of C. vittatus because a grol
domain was detected and was observed high similarity with many proteins of the
chaperonin family, a kind of protein present in the endosymbiotic bacterias of this
genus.
Palavras-chave
Camponotus vittatus, DDRT-PCR, Expressão gênica, Camponotus vittatus, Gene expression, Formiga, Formiga-Genética
Citação
RODOVALHO, Cynara de Melo. Detecção de genes diferencialmente expressos na formiga urbana Camponotus vittatus (Hymenoptera, Formicinae). 2006. 58 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2006.