Publicação: Mineração de regras para classificação de oncogenes medidos por microarray utilizando algoritmos genéticos
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CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
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Resumo
Técnicas de Inteligência Artificial (IA) têm se tornado cada vez mais importantes na
solução de problemas biológicos. Nesta dissertação, utilizamos um Algoritmo Genético
(AG) na busca de regras de alto nível do tipo IF-THEN. Este AG foi aplicado na mineração
de regras de classificação em uma base de dados de expressão gênica de células cancerígenas
(NCI60), advindas de experimentos de microarray. O objetivo dessa mineração é descobrir
relações entre os níveis de expressões gênicas e os nove tipos de classes de câncer analisados
neste trabalho.
Abstract
Artificial Intelligence techniques are increasing their role in the solution of biological
problems. The present study use a Genetic Algorithm (GA) in the search for high level
IF-THEN rules. This GA was applied to miner classification rules from a gene expression
database named NCI60. This database was developed using cancer cells measured by
microarray. The goal of this mining is the discovery of relations among gene expression
level and the nine types of cancer classes analyzed in this work.
Palavras-chave
Expressão gênica, Oncogenes, Bioinformatic, Gene expression, Genetic algorithms, Data mining, Bioinformática, Algoritmos genéticos
Citação
AMARAL, Laurence Rodrigues do. Mineração de regras para classificação de oncogenes medidos por microarray utilizando algoritmos genéticos. 2007. 142 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2007.