Publicação: Identificação de potenciais inibidores bioativos para candidatus liberibacter asiaticus: uma abordagem computacional contra o agente causador do Huanglongbing (HLB)
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Resumo
O huanglongbing (HLB), ou greening, é uma das doenças mais graves que afetam a
citricultura global, causada principalmente pela bactéria Candidatus Liberibacter
asiaticus, um fitopatógeno restrito ao floema que tem como inseto vetor o Diaphorina
citri. A urgência em buscar uma solução reside no severo impacto econômico e social
da doença no Brasil, um dos maiores produtores de Citrus spp. A inibição específica
dos transportadores de aminoácidos da família ABC, como a subunidade de ligação à
cistina (TcyA) — essencial para a sobrevivência e defesa antioxidante do
microrganismo —, representa uma estratégia crucial de manejo. Desse modo, este
trabalho teve como objetivo a identificação de potenciais inibidores bioativos para este
receptor, empregando metodologias de química computacional. O fluxo de trabalho
envolveu triagem virtual de alto rendimento, modelagem farmacofórica, docking
molecular e simulações de dinâmica molecular (100 ns). Os resultados culminaram na
identificação da molécula semissintética NB_2472, que demonstrou excelente afinidade
termodinâmica e capacidade de restringir a flexibilidade conformacional do sítio ativo
do receptor. A avaliação complementar evidenciou um perfil ADMET altamente
favorável para a NB_2472, atestando ausência de mutagenicidade (Teste de Ames Safe),
viabilidade de síntese industrial e potencial de translocação sistêmica. Adicionalmente,
os compostos NB_2458 e NB_2471 destacaram-se como promissoras alternativas
estratégicas, priorizando, respectivamente, segurança toxicológica máxima e baixo
custo de síntese. Conclui-se que a abordagem in silico aplicada é indispensável para o
enfrentamento deste fitopatógeno não cultivável, fornecendo o candidato a bioativo
NB_2472 como um protótipo molecular validado e seguro para o avanço das
investigações biotecnológicas e testes in vitro.
Abstract
Huanglongbing (HLB), or greening, is one of the most severe diseases affecting global
citriculture, primarily caused by the bacterium Candidatus Liberibacter asiaticus, a
phloem-restricted phytopathogen transmitted by the insect vector Diaphorina citri. The
urgency to find a solution lies in the severe economic and social impact of the disease in
Brazil, one of the world's largest producers of Citrus spp. The specific inhibition of
ABC family amino acid transporters, such as the cystine-binding subunit (TcyA)—
essential for the microorganism's survival and antioxidant defense—represents a crucial
management strategy. Therefore, this study aimed to identify potential bioactive
inhibitors for this receptor using computational chemistry methodologies. The workflow
involved high-throughput virtual screening, pharmacophore modeling, molecular
docking, and molecular dynamics simulations (100 ns). The results culminated in the
identification of the semisynthetic molecule NB_2472 as the lead candidate,
demonstrating excellent thermodynamic affinity and restriction of the active site's
conformational flexibility, combined with a highly favorable ADMET profile (absence
of mutagenicity, industrial synthesis viability, and systemic translocation potential).
Additionally, the compounds NB_2458 and NB_2471 stood out as promising strategic
alternatives, prioritizing maximum toxicological safety and low synthesis cost,
respectively. In conclusion, the applied in silico approach is indispensable for
combating this unculturable phytopathogen, providing validated and safe molecular
prototypes for the advancement of biotechnological investigations and in vitro tests.
Palavras-chave
Greening, Transportador ABC, Dinâmica Molecular, Triagem Virtual, Bioprodutos, ABC transporter, Molecular dynamics, Virtual screening, Bioproducts
Citação
TERRA, Victor Rodrigues. Identificação de potenciais inibidores bioativos para candidatus liberibacter asiaticus: uma abordagem computacional contra o agente causador do Huanglongbing (HLB). 2026. 43 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2026.
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