Publication: Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe
Loading...
submission.sections.submit.progressbar.describe.tipo
Date
submission.sections.submit.progressbar.describe.acesso
Collections
item.page.program
item.page.cnpq
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::CIENCIA DA COMPUTACAO
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
item.page.advisor1
item.page.coAdvisors
Summary
O presente Trabalho de Conclusão de Curso (TCC) representa um esforço para integrar duas ferramentas na área de bioinformática. A integração bem sucedida do sistema
Medpipe ao Pannotator, viabilizada pelo microsserviço ms-medpipe, oferece uma abordagem para a análise genômica. O microsserviço ms-medpipe, desenvolvido em Kotlin
com o framework Spring Boot, desempenha um papel central na automação do processamento Medpipe. A utilização de endpoints REST, como a execução do Medpipe de
forma assíncrona, busca de status e das predições geradas, contribui para a modularidade
e escalabilidade do sistema. A disponibilização da documentação dos endpoints, exemplos
de solicitações e logs detalhados facilitam a compreensão e utilização do ms-medpipe.
Os resultados obtidos destacam a importância das informações fornecidas pelo Medpipe,
enriquecendo a anotação genômica com mais detalhes, como a densidade de epítopos maduros (MED) e a classificação de proteínas de acordo com suas localizações subcelulares.
Com os resultados obtidos com a integração utilizando o ms-mdepipe o Pannotator ficou equivalente a programas que tentam prover mais do que apenas anotação de função
acrescentando dados sobre anotação sobre potencial imunológico, estrutura e localização
celular.
Abstract
Keywords
Bioinformática, Bioinformatics, Microsserviços, Microservices, Pannotator, Pannotator, Medpipe, Medpipe, Genômica, Genomics
Citation
GONÇALVES, Rafael Faria Macedo. Desenvolvimento e Integração de API REST para a Comunicação entre o Pannotator e o Medpipe. 2023. 41 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Sistemas de Informação) – Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2023.
item.page.doi
Collections
Endorsement
Review
Supplemented By
Referenced By
Creative Commons license
Except where otherwise noted, this item's license is described as Acesso Aberto