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Genômica comparativa de isolados de Enterobacter spp. com ênfase em genes de resistência antimicrobiana

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CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS

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A resistência antimicrobiana configura-se como uma das principais ameaças à saúde pública global, impactando diretamente a eficácia dos tratamentos e elevando as taxas de morbidade e mortalidade. Nesse contexto, a abordagem de Saúde Única destaca a interconexão entre saúde humana, animal e ambiental, sendo essencial para a compreensão da disseminação de microrganismos resistentes. Dentre esses, bactérias do gênero Enterobacter, especialmente aquelas pertencentes ao complexo Enterobacter cloacae, apresentam relevância devido à sua ampla distribuição e capacidade de adquirir e disseminar genes de resistência aos antimicrobianos. O presente estudo analisou, por meio da genômica comparativa, a diversidade genética e o perfil de resistência antimicrobiana de 51 genomas de Enterobacter hormaechei, com ênfase na cepa HOVB2, integrando isolados de origem humana, animal e ambiental obtidos do NCBI. Foram realizadas montagem, anotação genômica, identificação do resistoma, viruloma e elementos genéticos móveis, além de inferências taxonômicas e filogenômicas por meio de ferramentas como ANI e análise de pangenoma. A confirmação taxonômica por ANI (identidade entre 94,68% e 100% entre todos os genomas) validou que todos os isolados pertenciam à espécie E. hormaechei. O pangenoma revelou arquitetura aberta, com 11.743 genes totais, dos quais apenas 26,5% (3.109 genes) compuseram o core genome, 4.052 genes exclusivos concentraram-se na Interface Clínica Humana e 4.201 genes acessórios (35,7%) foram compartilhados entre duas ou mais interfaces. A análise do plasmidoma e do viroma indicou predominância das famílias de replicons IncF e IncHI2 e de bacteriófagos temperados na interface clínica, sugerindo papel ativo desses elementos móveis na disseminação de determinantes de resistência. A filogenômica não revelou segregação clonal nítida por nicho ecológico, e o resistoma mostrou mecanismos basais (efluxo RND, AmpC intrínseca) amplamente compartilhados entre interfaces, enquanto as carbapenemases, embora predominantes na interface clínica, também foram detectadas nas interfaces animal e ambiental/silvestre. Os resultados reforçam o conceito de Saúde Única e apontam para a necessidade de programas de vigilância genômica integrada entre as frentes humana, animal e ambiental para o monitoramento e controle da disseminação da resistência antimicrobiana.

Abstract

Palavras-chave

resistência antimicrobiana, antimicrobial resistance, Enterobacter hormaechei, genômica comparativa, Saúde Única, pangenoma, Enterobacter hormaechei, comparative genomics, One Health, pangenome

Citação

MENDONÇA, Bárbara Ribeiro. Genômica comparativa de isolados de Enterobacter spp. com ênfase em genes de resistência antimicrobiana. 2026. 77 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Zootecnia) – Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2026.

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