Publicação: Banco referencial molecular para a ictiofauna da bacia hidrográfica do Alto Paraná
Carregando...
Tipo do documento
Data
Direito de acesso
Programa
Área do conhecimento
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Orientador
Coorientador
Resumo
A ictiofauna dos ambientes dulcícolas neotropicais é a mais especiosa do planeta, incluindo
mais de 6.200 espécies com aproximadamente 340 delas ocorrendo na bacia do Alto Paraná,
no bioma Cerrado. Esta drenagem engloba rios da região centro-sul do Brasil e possui uma das
ictiofaunas mais ameaçadas da América do Sul, devido em grande parte, à existência de
barragens hidrelétricas que isolam populações de múltiplos organismos. Dado algumas
exceções, as distribuições dos peixes no Alto Paraná são pobremente delimitadas, o que
dificulta ações efetivas e políticas públicas de conservação dos sistemas aquáticos do Cerrado.
Técnicas de sequenciamento de DNA ambiental têm se mostrado promissoras na identificação
das espécies, com levantamentos precisos e sem a necessidade de uma abordagem invasiva.
Tais técnicas utilizam o material genético presente no ambiente, especialmente o DNA
mitocondrial e o sequenciamento de nova geração (NGS) para inventariar comunidades locais.
A precisão das identificações de sequências de DNA ambiental depende da organização de um
banco referencial genômico confiável, onde as mesmas possam ser comparadas com o DNA
barcoding oriundas de espécimes testemunhos depositados em coleções científicas. Entretanto,
não existe atualmente um banco referencial de sequências de DNA suficientemente abrangente
para os peixes da bacia do Alto Paraná que possibilite a identificação da ictiofauna residente e
transiente dessa região. Devido a essa problemática, este estudo organizou uma lista com
sequências depositadas em repositórios como o GenBank e BOLD para o gene COI,
considerando os indivíduos amostrados na bacia. Além disso, será organizado um banco
referencial inédito composto por genomas mitocondriais completos para facilitar a
identificação de sequências provenientes de outros marcadores mitocondriais, portanto
contribuindo para viabilizar estudos sobre conservação da ictiofauna e seus padrões espaciais
na bacia do Alto Paraná.
Abstract
The ichthyofauna of neotropical freshwater environments is the most specious on the planet,
including more than 6,200 species, with approximately 340 of them occurring in the Alto
Paraná basin, in the Cerrado biome. This drainage encompasses rivers in the south-central
region of Brazil and has one of the most endangered ichthyofaunas in South America, largely
due to the existence of hydroelectric dams that isolate populations of multiple organisms. Given
some exceptions, fish distributions in the Upper Paraná are poorly defined, which makes
effective actions and public policies for the conservation of the Cerrado aquatic systems
difficult. Environmental DNA sequencing techniques have shown promise in identifying
species, with accurate surveys and without the need for an invasive approach. Such techniques
use the genetic material present in the environment, especially mitochondrial DNA and next
generation sequencing (NGS) to inventory local communities. The accuracy of identification
of environmental DNA sequences depends on the organization of a reliable genomic reference
bank, where they can be compared with DNA barcoding from test specimens deposited in
scientific collections. However, there is currently no sufficiently comprehensive reference bank
of DNA sequences for fish in the Upper Paraná Basin to enable the identification of resident
and transient ichthyofauna in this region. Due to this problem, this study will organize a list
with sequences deposited in repositories such as GenBank and BOLD for the COI gene,
considering the individuals sampled in the basin. In addition, an unpublished reference bank
composed of complete mitochondrial genomes will be organized to facilitate the identification
of sequences from other mitochondrial markers, thus contributing to enable studies on the
conservation of ichthyofauna and their spatial patterns in the Upper Paraná basin.
Palavras-chave
Banco genômico, Peixes, Bacia do Alto rio Paraná, eDNA
Citação
SANTOS, Gabriela Peres dos Reis. Banco referencial molecular para a ictiofauna da bacia hidrográfica do Alto Paraná. 2024. 34 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2024.
DOI
Avaliação
Revisão
Suplementado Por
Referenciado Por
Licença Creative Commons
Exceto quando indicado de outra forma, a licença deste item é descrita como Acesso Aberto