Publicação: Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade
Carregando...
Arquivos
Tipo do documento
Data
Direito de acesso
Coleções
Área do conhecimento
CNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICA
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Autores
Orientador
Coorientador
Resumo
Estudo do sistema DNA-cisplatina usando a teoria do funcional da densidade (DFT) compara a eficiência dos funcionais de correlação e troca LDA e GGA(PBE) na simulação
das bases nitrogenadas como também os conjuntos de base DZP e DZ. Fazendo as opções DZP e LDA e com a utilização de pseudopotenciais Ceperley-Alder de norma conservada
executa cálculos de simulação da cisplatina, bases isoladas, pares de bases, fragmento de
DNA com dois pares de bases GG e do sistema DNA-ciplatina ligada em conjunto de bases
GG e AG. Apresenta roteiro de execução para a gradual aproximação da estrutura de fato
do DNA. Reedita para essas estruturas resultados estabelecidos na literatura científica,
como apresenta novos resultados para a distribuição eletrônica do DNA. Apresenta argumenta
ção, baseada na interação de dipolos entre cisplatina e DNA para a existência de
uma barreira de potencial que restringe a possibilidade da ligação para o caso da ligação
na sequencia guanina-adenina do DNA.
Abstract
Study of the DNA-cisplatin system using the Density Functional Theory(DFT), compares
the eficiency of the correlation and exchange functionals LDA and GGA (PBE) in
the simulation of the nitrogen bases as well as the basis sets DZP and DZ. Taking DZP and
LDA options and with the use of the norm-conserved pseudopotentials Ceperley-Alder,
simulate the sistems; cisplatina, isolated DNA bases, pairs of bases, DNA fragment with
two pairs of bases GG and on the DNA-ciplatin system attached in GG and GA bases.
It presents script of execution for the gradual approach of the real structure of the DNA.
Reedits for these structures facts established in scientific literature, as it presents new facts
for the electronic distribution of the DNA. Argues based in the interaction of dipoles between
cisplatin and DNA, the existence of a potential barrier that restricts the possibility
of the bond for the case of the linking in sequence GA of the DNA.
Palavras-chave
Teoria do funcional da densidade, Aproximação de densidade local, Aproximação de gradiente generalizado, DNA, Cisplatina, Density functional theory, Local density approximation, Generalized gradient approximation, Cisplatin
Citação
PAIVA, Humberto Alencar de. Caracterização energética e estrutural da interação DNA-cisplatina pela teoria do funcional da densidade. 2007. 99 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Exatas e da Terra) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2007.