Publicação: Micrornas em alface (Lactuca sativa): novas descobertas sobre a regulação gênica pós-transcricional
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CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA, CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA
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Gomes, Matheus de Souza
Resumo
Os microRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificantes que atuam na regulação pós-transcricional da expressão gênica em plantas, participando de processos relacionados ao desenvolvimento, metabolismo e respostas a estresses bióticos e abióticos. Apesar da relevância biológica desses reguladores, ainda existem poucas informações sobre os componentes da via de processamento de miRNAs em Lactuca sativa L., uma das hortaliças folhosas de maior importância econômica mundial. Dessa forma, este trabalho teve como objetivo identificar e caracterizar proteínas envolvidas na biogênese de miRNAs, bem como predizer e analisar famílias conservadas de miRNAs em L. sativa cv. Salinas e L. sativa var. angustana. As análises foram realizadas por meio de mineração genômica, alinhamentos múltiplos, predição de domínios conservados, análises termodinâmicas e inferências filogenéticas utilizando sequências ortólogas de espécies vegetais. Adicionalmente, foram identificadas 193 sequências (3p e 5p) de miRNAs maduros e 137 miRNAs precursores, distribuídos em 36 famílias distintas de miRNAs. Os precursores apresentaram estruturas secundárias estáveis e parâmetros termodinâmicos compatíveis com miRNAs verdadeiros. De modo geral, os resultados obtidos ampliam o conhecimento sobre a via de processamento de miRNAs em alface e fornecem bases importantes para estudos funcionais relacionados à regulação gênica, desenvolvimento vegetal e aplicações biotecnológicas voltadas ao melhoramento genético da espécie.
Abstract
MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs involved in the post-transcriptional regulation of gene expression in plants, participating in processes related to development, metabolism, and responses to biotic and abiotic stresses. Despite the biological relevance of these regulators, there is still limited information regarding the components of the miRNA processing pathway in Lactuca sativa L., one of the most economically important leafy vegetables worldwide. Therefore, this study aimed to identify and characterize proteins involved in miRNA biogenesis, as well as to predict and analyze conserved miRNA families in L. sativa cv. Salinas and L. sativa var. angustana. The analyses were performed through genome mining, multiple sequence alignments, conserved domain prediction, thermodynamic analyses, and phylogenetic inference using orthologous sequences from plant species. Additionally, 193 mature miRNA sequences (3p and 5p) and 137 precursor miRNAs were identified, distributed among 36 distinct miRNA families. The precursors exhibited stable secondary structures and thermodynamic parameters compatible with true miRNAs. Overall, the results obtained expand the current knowledge regarding the miRNA processing pathway in lettuce and provide an important basis for future functional studies related to gene regulation, plant development, and biotechnological applications aimed at crop improvement.
Palavras-chave
microRNAs., Lactuca sativa., silenciamento gênico., biogênese de miRNAs., gene silencing, miRNA biogenesis
Citação
DAMIÃO, Higo Sanches Batista. Micrornas em alface (Lactuca sativa): novas descobertas sobre a regulação gênica pós-transcricional/ . 2026. 103 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia, Patos de minas, 2026. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.di.2026.5545.