Publicação: Salmonella Heidelberg isoladas na cadeia produtiva de frangos de corte:biofilmes e controle, virulência, resistência antimicrobiana e implicações em saúde pública.
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CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
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Resumo
Salmonella Heidelberg é considerado um sorovar emergente, devido ao
aumento de seu isolamento em alimentos, especialmente na carne de frango e
derivados, bem como pelo seu envolvimento em surtos de infecções em
humanos. A tese está dividida em três capítulos, sendo o primeiro composto
pelas considerações gerais do tema, abordando assuntos chave que auxiliam
na contextualização do que será abordado nos demais capítulos. O segundo
capítulo possuiu como objetivo analisar 20 cepas de S. Heidelberg,
provenientes de amostras avícolas da região sul do país quanto aos genes
relacionados à virulência (ompC, invA, sodC, avrA, lpfA, agfA e luxS) e
resistência antimicrobiana (qnrS e qnrA – fluoroquinolonas; blaTEM e blaSHV - βlactâmicos), bem como determinar os perfis de resistência à drogas/classes de
importância na medicina veterinária e humana (amoxicilina com clavulanato:
classe dos β-lactâmicos, subclasse das penicilinas; colistina: classe das
polimixinas; ciprofloxacina: classe das fluoroquinolonas; ceftriaxona: classe dos
β-lactâmicos, subclasse das cefalosporinas de 3ª geração). Para pesquisa dos
genes de virulência e de resistência no segundo capítulo, foi utilizada a técnica
de PCR e para a avaliação da sensibilidade antimicrobiana foi realizada a
determinação pela concentração inibitória mínima (CIM). O terceiro capítulo
objetivou analisar duas cepas de S. Heidelberg, isoladas de amostras de frango
de corte produzidos no sul do Brasil, quanto à capacidade de adesão, formação
e inibição de biofilmes com e sem a adição de chicken juice em três
temperaturas diferentes, 4, 25 e 37ºC. Avaliou também a estrutura
microscópica do biofilme e o sequenciamento genômico total das cepas para
determinar a presença de genes de resistência. As análises de formação de
biofilmes foram realizadas em microbiologia tradicional utilizando caldo Tryptic
Soy Broth (TSB) e, paralelamente, em TSB suplementado com chicken juice
(TSB + CJ) de formas quantitativa e qualitativa. A morfologia dos biofilmes foi
avaliada por microscopia eletrônica de varredura (MEV). Os testes de inibição
foram feitos com sanitizantes utilizados na indústria (hipoclorito, clorexidina e
ácido peracético) e o sequenciamento genômico foi efetuado no sistema Illumina
HiSeq e para a montagem das leituras obtidas no sequenciamento, foi utilizado
o software fastQC.
Abstract
Salmonella Heidelberg is considered an emerging serovar because of its
increased isolation in food, especially in chicken meat and its derivatives, as
well as its involvement in outbreaks of infections in humans. The thesis is
divided into three chapters, the first consisting of the general considerations of
the theme, addressing key issues that helps in contextualizing what will be
discussed in the next chapters. The second chapter aimed to analyze 20 strains
of S. Heidelberg, from poultry samples originated from the southern region of
the country regarding the genes related to virulence (ompC, invA, sodC, avrA,
lpfA, agfA and luxS) and antimicrobial resistance (qnrS and qnrA -
fluoroquinolones; blaTEM and blaSHV - β-lactams), as well as to determine the
antimicrobial resistance profiles of drugs / classes of importance in veterinary
and human medicine (amoxicillin with clavulanate: β-lactams class, subclass of
penicillins; colistin: class of polymyxins; ciprofloxacin: fluoroquinolone class;
ceftriaxone: β-lactam class, subclass of 3rd generation cephalosporins). For the
research of virulence and resistance genes in the second chapter, the PCR
technique was used and the antimicrobial sensitivity was determined by the
minimum inhibitory concentration (MIC). The third chapter aimed to analyze two
strains of S. Heidelberg, isolated from broiler samples produced in southern
Brazil, regarding the adhesion, formation and inhibition of biofilms with and
without the addition of chicken juice at three different temperatures, 4, 25 and
37 ° C. It also evaluated the microscopic structure of the biofilm and the total
genomic sequencing of the strains. In the third chapter, biofilm formation
analyzes were performed in traditional microbiology using Tryptic Soy Broth
(TSB) and in parallel in TSB supplemented with chicken juice (TSB + CJ) in
quantitative and qualitative ways. Biofilm morphology was evaluated by
scanning electron microscopy (SEM). Inhibition tests were performed with
sanitizers used in industry (hypochlorite, chlorhexidine and peracetic acid) and
genomic sequencing was performed on the Illumina HiSeq system and fastQC
software was used to assemble the sequencing readings.
Palavras-chave
Chicken juice, CIM, Microscopia eletrônica de varredura, Salmonelose, Sequenciamento, Chicken juice, MIC., Scanning electron microscopy, Salmonellosis, Sequencing
Citação
GALVÃO, Newton Nascentes. Salmonella Heidelberg isoladas na cadeia produtiva de frango de corte: biofilmes e controle, virulência, resistência antimicrobiana e implicações em saúde pública. 2019. 109 f. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2019. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.te.2019.2600.