Publicação: Caracterização in silico de STRs em genomas de Aspergillus niger visando ao desenvolvimento de marcadores moleculares para cepas de bioinsumos agrícolas
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CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS
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Orientador
Coorientador
Siquieroli, Ana Carolina Silva, Carneiro, Murillo Guimarães
Resumo
A microbiota do solo, especialmente os fungos, desempenham papel central na promoção do
crescimento vegetal e na ciclagem de nutrientes. Entre eles, Aspergillus niger destaca-se por
seu potencial biotecnológico, contribuindo para a solubilização de fosfatos e o estímulo ao
desenvolvimento das plantas, sendo amplamente utilizado como bioinsumo. No entanto, a
aplicação desses microrganismos requer o desenvolvimento de estratégias que possibilitem o
rastreamento preciso e confiável do destino e do comportamento das cepas introduzidas no
ambiente. Nesse contexto, o presente estudo visa aprofundar a caracterização genômica de A.
niger, com foco em microssatélites (short tandem repeats, STRs), para a identificação de
marcadores genéticos com alto poder discriminatório entre cepas, por meio de um fluxo
integrado de detecção, avaliação de variabilidade e validação in silico. Além de ampliar a
caracterização desses marcadores, a estratégia proposta busca oferecer uma abordagem
computacional eficiente, reprodutível, escalável e de baixo custo, reduzindo a dependência de
etapas experimentais nas fases preliminares de desenvolvimento dos marcadores moleculares.
Abstract
Soil microbiota, particularly fungi, play a central role in plant growth promotion and nutrient
cycling. Among them, Aspergillus niger stands out due to its biotechnological potential,
contributing to phosphate solubilization and enhancing plant development. However, the
application of such microorganisms requires robust strategies to enable precise and reliable
tracking of the fate and behavior of introduced strains under environmental conditions. In this
context, this study advances the genomic characterization of A. niger by focusing on
microsatellites (short tandem repeats, STRs) for the identification of genetic markers with high
discriminatory power among strains, through an integrated in silico workflow of detection,
variability assessment and validation. In addition to expanding the characterization of these
markers, the proposed strategy provides an efficient, reproducible, scalable, and cost-effective
computational framework that reduces reliance on experimental procedures during the early
stages of molecular marker development.
Palavras-chave
Bioinformática, Biologia molecular, Fungo, Microssatélites, SSR, Sustentabilidade, Bioinformatics, Molecular biology, Fungus, Microsatellites, Sustainability, Agronomia
Citação
ROCHA, Mário Lúcio Martins. Caracterização in silico de STRs em genomas de Aspergillus niger visando ao
desenvolvimento de marcadores moleculares para cepas de bioinsumos agrícolas. 2026. 38 f. Dissertação (Mestrado em Agricultura e Informações Geoespaciais) - Universidade Federal de Uberlândia, Monte Carmelo, 2026. DOI http://doi.org/10.14393/ufu.di.2026.552.